開源藥物發現引擎 OpenDDE：整合折疊、推理與縮放的生物分子基礎模型

研究團隊推出開源的全原子生物分子基礎模型 Open Drug Discovery Engine（OpenDDE），該模型以共折疊（co-folding）作為進入點，旨在解決生物學與治療發現中準確模擬生物分子互動的核心瓶頸。OpenDDE 不再將結構預測視為孤立的終點，而是設計為一個共享的結構推理層，用於建模生物分子複合物中的序列、結構與功能關係。

在技術整合方面，OpenDDE 結合了最新的全原子架構、原子潛在推理、推理最佳化以及大規模資料處理技術。這些技術的整合使該模型在可複製且開放的框架內，達到了與 IsoDDE 級別相同的共折疊準確度。研究同時識別出共折疊模型的兩個擴展法則方向，揭示了透過資料、模型、推理與訓練擴展來持續改進的實際途徑。

透過釋出訓練程式碼、推理管線、檢查點與基準測試，OpenDDE 致力於普及前沿生物分子智慧並加速全球合作。該框架目前支援複雜結構預測，並為後續的从头設計（de novo design）、親和力估計、結構條件最佳化以及下一代藥物發現系統奠定了基礎，推動研究從預測分子結構轉向設計、評分與最佳化治療候選者。